При этом методе лечения одно полушарие мозга (левый префронтальный участок коры головного мозга) подвергается действию сильного магнитного поля с целью позитивного воздействия на депрессивное состояние. После неоднократного воздействия магнитного поля в этом отделе мозга изменяется кровоснабжение и метаболизм (процесс обмена веществ). В лечебных целях здесь используется закон электромагнитной индукции, открытый Фарадеем в 1831 г. В 1980-х гг. был создан первый прибор для транскраниальной магнитной стимуляции. Обычно проводится около 10 сеансов в течении двух недель. Этот метод лечения дает весьма небольшую психологическую нагрузку, однако достигнутые до сих пор результаты скорее разочаровывают. Они ниже результатов, достигаемых с помощью обычно принятых фармакологических методов лечения. Этот метод (пока еще) не принадлежит к регулярно применяемым в больницах и поликлиниках формам терапии.